A variante delta do SARS-CoV-2 já circulava com transmissão comunitária no Brasil em junho e foi introduzida no país por pelo menos dez fontes diferentes. Essas são algumas das conclusões de um estudo publicado em meados de outubro na plataforma de preprints medRxiv, na qual pesquisadores do Instituto Butantan, do Hemocentro de Ribeirão Preto, da Universidade de São Paulo, da Universidade Estadual Paulista, da Universidade Federal de Minas Gerais, da Fundação Oswaldo Cruz e da Secretaria Municipal de Saúde de São Paulo, entre outras instituições, caracterizaram pela primeira vez os padrões da disseminação da variante delta pelo Brasil e identificaram a origem das introduções da linhagem no país.

De acordo com as análises, algumas das dez introduções ocorridas no Brasil até o final de setembro foram relacionadas com amostras da variante delta em circulação na Austrália e nos Estados Unidos, enquanto outras se relacionaram com amostras do Reino Unido. Quanto à transmissão comunitária, que já se encontrava estabelecida desde junho, foram detectadas ao menos quatro cadeias de transmissão independentes: no Rio de Janeiro, em Goiás, no Maranhão e no Paraná. 

O estudo foi realizado a partir dos dados coletados pela Rede de Alerta das Variantes do SARS-CoV-2 do estado de São Paulo, liderada pelo Butantan e que já sequenciou mais de 30 mil amostras do vírus causador da Covid-19. “Na semana epidemiológica 27 (no início de julho, quando os dados foram coletados), tínhamos 17 mil amostras sequenciadas na Rede, e um total de 98 amostras com a variante delta”, explica a diretora do Centro de Desenvolvimento Científico do Butantan, Sandra Coccuzzo, que é coordenadora da Rede.

Para caracterizar e contextualizar o caminho da delta no estado de São Paulo e, especialmente, na cidade de São Paulo, os pesquisadores reuniram um conjunto de dados global e representativo disponível na plataforma GISAID (sigla para global initiative on sharing all influenza data), iniciativa que fornece acesso aberto a dados genômicos do vírus influenza e do coronavírus. Atualmente, estão depositados ali 170 mil genomas da variante delta.

A variante delta no Brasil

O Brasil tem sido uma fonte contínua de novas variantes de Covid-19 desde o final de 2020, com o surgimento em Manaus da variante de preocupação gama (ou P.1), que se espalhou pelo país a partir de janeiro de 2021, tornando-se eventualmente responsável por mais de 90% dos casos